Skanderborg Station er en dansk jernbanestation i Skanderborg i Østjylland. Stationen ligger på jernbanestrækningen fra Fredericia til Aarhus og er desuden udgangspunkt for jernbanestrækningen mod Ry, Silkeborg, Ikast, Herning og Skjern. Skanderborg Station åbnede i 1868, da jernbanestrækningen fra Fredericia til Aarhus åbnede. Perrontunnelen blev anlagt i 1893 som den første af sin art i Danmark. Stationen betjenes af tog fra DSB og Arriva.